工程支付保函是指建筑工程项目中，甲方委托保险机构对乙方的履约能力做出担保，并以支付保函形式提供给乙方使用。在签发和使用过程中，涉及到一定的手续费。
工程支付保函手续费入账是指将从申请人处收取的工程支付保函的手续费金额纳入到相关账户中。这个过程需要依据相关规章制度和合同约定进行操作。
一般来说，工程支付保函手续费入账分为以下几个步骤：
第一步，确认手续费支付方式。根据合同约定，确认手续费由申请人直接支付还是通过贷款等方式支付。
第二步，确定手续费金额。根据合同约定和保险公司的费率标准，计算出手续费的具体金额。
第三步，生成支付通知单。保险公司会根据手续费金额，填写支付通知单，并将该通知单发送给申请人。
第四步，支付手续费。申请人收到支付通知单后，按照通知单的要求，选择相应的支付方式进行手续费支付。
第五步，检验付款凭证。申请人支付完成后，保险公司会核对付款凭证并确认金额无误。
第六步，手续费入账。经过核对无误后，保险公司将手续费金额纳入相关账户，并记录入账信息。同时，通知申请人手续费已经成功入账。
工程支付保函手续费入账是一项重要的财务操作，需要严谨、准确地执行。只有确保手续费的正确入账，才能有效管理和使用这笔资金。
同时，申请人也应留存好付款凭证等相关材料，以备日后查询和审计之需。
总而言之，工程支付保函手续费入账是一个涉及多个环节和各方合作的过程。双方需要根据合同约定和相关规章制度，按照规定的步骤和程序进行操作，确保手续费的正确入账。
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