银行保函和商业保函都是保证当事人之间合同义务履行或赔偿损失的一种担保性函件，但两者在性质、适用范围、效力等方面存在一定区别。
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下面我们将从定义、适用范围、效力等方面详细分析比较两者的区别：
银行保函是指银行应客户申请，根据客户的委托或授权，以书面形式向保函受益人做出的担保函件。它是一种独立保证，与被保证的合同关系没有直接联系。银行保函适用于各种经济贸易活动中，如商品进出口、工程招投标、承包工程款支付担保、预付货款担保、履行合同义务担保等。
商业保函是指自然人、法人或其他组织为保证经济合同的履行或赔偿经济合同的损失，向合同相对方出具的担保函件。它是一种合同担保，与主合同具有直接联系，是主合同的从合同。商业保函主要适用于国内经济贸易活动中，如商品买卖、工程建设、租赁等。
银行保函具有独立性、抽象性、形式性和强制性等特征。银行保函一经出具，对银行即具有法律约束力，银行不得以任何理由拒绝履行保函义务。银行保函的效力独立于被担保的合同，即使主合同无效或被撤销，银行保函仍然有效。银行在出具保函时，不对被担保的合同进行实质审查，只对申请人的资信情况进行审查。因此，银行承担的风险较大，一旦申请人无力履行合同义务或拒绝承担保函责任，银行将面临较大的损失。
商业保函的效力取决于其所担保的主合同的效力。如果主合同无效或被撤销，商业保函也随之失去效力。商业保函的出具方通常对主合同的履行情况和对方当事人的履约能力进行审查，以判断担保的风险。如果担保一方无力履行主合同义务，出具商业保函的一方需要承担连带责任。因此，商业保函的风险相对较小，但担保效力也受到一定限制。
办理银行保函，申请人需要向银行提交申请材料，包括营业执照、财务报表、担保金、相关合同等。银行对申请人的资信情况和担保能力进行审查，符合条件后出具保函。银行保函的收费标准通常包括担保费、手续费、电报费等，具体金额根据担保金额和期限等因素确定。
商业保函的办理程序相对简单，担保方与被担保方直接签订担保协议即可。商业保函的收费标准由双方协商确定，通常包括担保费、管理费等。
银行保函适用《担保法》和《银行法》等相关法律法规。如果发生纠纷，可以向银行所在地人民法院提起诉讼，或通过银行业协会等行业组织进行调解。
商业保函适用《合同法》和《担保法》等相关法律法规。如果发生纠纷，可以向担保方所在地人民法院提起诉讼，或通过双方约定的仲裁机构进行仲裁。
除了上述区别外，银行保函和商业保函在担保金额、担保期限、担保方式等方面也可能存在差异。银行保函的担保金额和期限通常较高较长，而商业保函的担保金额和期限相对较小较短。银行保函的担保方式通常为见索即付，而商业保函的担保方式则可能包括见索即付、见票即付、见单即付等。
总之，银行保函和商业保函在适用范围、效力、风险、办理程序等方面存在一定区别。了解两者的区别，有助于当事人选择合适的担保方式，保障自身权益。
