投标保函扣款是投标过程中常见的情况。当投标方未能履行投标文件中的承诺时，发标方有权扣除投标保函中的款项。但需要注意的是，投标保函扣款时扣的是谁的钱，需要根据具体情况分析。
投标保函是由担保人（一般为银行）发行的，担保人承诺在投标方违约时向发标方支付一定金额。因此，当投标方违约后，扣除投标保函中的款项时，扣除的是担保人的钱。
投标方是向发标方提交标书的企业或个人，投标方在提交投标保函时，同时提交了投标文件，并在投标文件中做出相关承诺。
当投标方违约时，意味着投标方未能履行投标文件中做出的承诺。在这种情况下，虽然扣除的是担保人的钱，但最终的责任人应该是投标方。
原因在于，担保人只是担保投标方的信用，当投标方违约时，担保人代投标方向发标方支付违约金。但投标方作为违约方，仍然需要对自己的违约行为承担责任。
除了上述基本原则外，在不同的具体情况下，投标保函扣款的责任可能存在差异，需要具体分析处理。
在这种情况下，扣除的投标保函款项属于违约赔偿金，由投标方承担责任，担保人代投标方向发标方支付违约金。
这种情况属于投标方单方面放弃中标资格，由投标方承担责任，扣款金额由担保人承担，但投标方仍然需要向担保人赔偿因违约造成担保人支付给发标方的违约金。
这种情况属于投标方违约，由投标方承担责任，扣款金额由担保人承担，同时投标方需要向发标方承担违约赔偿责任，向担保人承担赔偿担保人损失的责任。
在这种情况下，扣款金额由投标方承担，扣款原因是投标方未能按时支付履约保函费用，导致担保人无法为其继续提供履约担保。
为了避免投标保函扣款，投标方应注意以下事项：
在提交投标前，仔细阅读投标文件，确保充分理解发标方的要求。 在签订投标保函协议时，详细了解担保人提供的条款和条件，确保自身利益得到保障。 在投标过程中，诚信守约，按时提交投标书，中标后积极签订合同并履约。 及时支付履约保函费用，避免因费用逾期导致合同违约。投标保函扣款时扣谁的钱，需要根据具体情况进行分析。一般情况下，扣除的是担保人的钱，但最终责任人应该是投标方。投标方在投标过程中应注意诚信守约，认真履行合同义务，避免因违约造成不必要的损失。
