在商业合作中，预付款和保函是保障双方利益的重要手段。预付款是指一方当事人(通常是买方)在合同约定的付款时间之前，预先支付给另一方当事人(通常是卖方)的部分货款。而保函则是指由银行或担保公司等金融机构，应一方当事人(申请人)的申请，向另一方当事人(受益人)开立的书面保证承诺，承诺在申请人未能履行合同约定的义务时，由担保机构代为履行或赔偿损失。预付款超过一定比例，要求提供保函，可以有效降低受益人的资金风险。
目前，中国法律法规并没有对预付款超过多少需要提供保函做出明确规定，一般依据合同法的相关规定，以及行业惯例和双方当事人的协商确定。
《中华人民共和国合同法》第二百一十六条规定：“当事人可以约定一方向对方给付定金作为债权的担保。债务人履行债务后，定金应当抵作价款或者收回。给付定金的一方不履行约定的债务的，无权要求返还定金；收受定金的一方不履行约定的债务的，应当双倍返还定金。”
根据上述规定，预付款是否需要提供保函以及保函的比例可由双方在合同中自由约定。实践中，一般会根据项目金额、交易风险、行业惯例等因素综合考虑。
虽然法律没有明确规定，但实际操作中，多个因素会影响预付款是否需要保函以及保函的比例：
1. 项目金额: 项目金额越大，预付款比例和保函比例往往越高，用以规避更大的资金风险。
2. 交易风险: 如果交易风险较高，例如合作方信誉度低、项目周期长、市场波动大等， 则更有可能要求提供保函，且保函比例也可能更高。
3. 行业惯例: 部分行业存在较为成熟的预付款和保函制度，例如建筑行业、工程承包行业等，通常会参照行业标准来确定保函比例。
4. 双方谈判力: 最终的预付款比例和保函比例，取决于交易双方的谈判能力和风险承受能力。实力雄厚的企业往往拥有更高的议价能力，可以争取更低的保函比例，甚至免除保函。
虽然法律没有明文规定，但实践中，常见的预付款保函比例主要有以下几种：
1. 100% 保函: 即预付款金额的100%需提供保函。这种情况常见于交易金额巨大、风险较高的项目，或是合作一方信用记录不佳的情况下，旨在最大程度保障受益人资金安全。
2. 按比例提供保函: 这是最常见的形式，比例通常在 10% 到 50% 之间，根据项目具体情况和双方协商确定。例如，预付款为合同总价的 30%，双方可以约定提供相当于预付款 50% 的保函，即 15% 的合同总价。
3. 无需提供保函: 对于一些金额较小，风险较低的项目，或者双方已经建立了长期稳定的合作关系，彼此信任度较高，可以无需提供保函。
设置预付款保函的目的是为了在交易中平衡双方的利益，有效地降低受益人的资金风险， 具体包括以下几个方面：
1. 保障资金安全: 预付款保函可以有效保障受益人的资金安全。如果申请人未能按照合同约定履行义务，受益人可以凭借保函向担保机构索赔，弥补资金损失。
2. 促进合同履行: 申请人需要为保函支付一定的费用，这在一定程度上能够促使申请人认真履行合同义务，避免违约风险。
3. 提高交易效率: 预付款保函能够增加交易双方的信任度，促进交易顺利进行，提高交易效率，特别是对于一些大型工程项目或跨国交易来说尤为重要。
总而言之，预付款超过多少需要提供保函，需要根据具体情况具体分析，综合考虑项目金额、交易风险、行业惯例、双方谈判力等因素。在签订合同时，交易双方应当对预付款保函条款进行明确约定，包括保函比例、担保期限、担保范围以及索赔程序等，以避免后期出现争议，保障自身合法权益。
