建设工程预付款保函是在建设施工项目中常见的保险方式之一。它是由银行或保险公司出具的，以保证保函受益人能够按照合同要求提供工程进度所需的预付款。
预付款保函的费用是根据一定的比例计算的，通常为保函金额的千分之三到千分之五之间。这个费用主要是包括了开立保函所需的手续费、银行或保险公司的风险管理费用等。
首先，开立保函需要支付一定的手续费。这笔费用主要用于银行或保险公司处理申请、审查相关资料、进行风险评估等工作。手续费的多少通常与保函金额有关，一般来说，保函金额越大，手续费就越高。
其次，银行或保险公司还会收取风险管理费用。这项费用是为了覆盖保险公司对工程项目风险的管理和处理所产生的成本。例如，在建设工程过程中，如果发生了某些意外事件，导致工程无法按时完成或造成损失，保险公司就需要承担相应的赔偿责任。为了管理这些风险，保险公司需要投入一定的人力和物力，因此会收取风险管理费用。
要注意的是，预付款保函的费用是根据实际金额计算的，通常以千分之为单位。而且，在实际操作中，不同的银行或保险公司可能会有不同的费率标准，所以在选择合作机构时需要仔细比较并选择最适合自己的合作伙伴。
总之，建设工程预付款保函的费用是由手续费和风险管理费用组成的。在选择合作机构时，需要对比各家机构的费率标准，并考虑实际情况选择最合适的伙伴，以确保能够获得良好的保障和服务。
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