银行保函和承兑保兑支票是商业交易中常用的两种金融工具，它们在形式和功能上有着一些区别。
首先，银行保函是指银行根据委托人的请求，向受益人发出的一种书面承诺。它是一种由银行作为担保方，对委托人向受益人承诺提供付款、履约等担保责任的方式。在一笔合同交易中，如果委托人无法履行合同义务，受益人可以向银行主张权益。而承兑保兑支票则是指出票人在支票上附加了银行的承兑保证，即银行在支票上签字并表示愿意承兑支票的付款责任。
其次，银行保函是一种无条件的担保，即银行保证在符合特定条件下，按照保函上约定的金额进行支付。而承兑保兑支票则是一种有条件的支付工具，只有在支票到期日或经过特定条件满足后才能够由银行进行付款。
另外，银行保函一般适用于大型商业交易，特别是涉及跨国贸易的合同。它可以为卖方提供付款担保，确保买方按时支付货款；也可以为买方提供履约担保，确保卖方按合同提供服务或交付商品。而承兑保兑支票一般适用于国内交易，特别是小额交易。由于承兑支票需要出票人在银行开设账户并提供足够的资金作为担保，因此其可信度较高。
最后，银行保函和承兑保兑支票在法律效力上也存在差异。银行保函一般受到国内外法律的保护，其失效或不履行可能对银行造成法律责任。而承兑保兑支票在贸易纠纷中一般属于民事债权的范畴，当持票人要求付款时，出票人无法履行支付义务，则会依据相应法律规定进行追偿。
综上所述，银行保函和承兑保兑支票具有不同的定义、功能、适用范围和法律效力。在商业交易中选择适合的金融工具是确保交易安全和顺利进行的重要环节。
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